El Departamento de Vulcanología tiene como objetivo principal la comprensión de los fenómenos volcánicos y sus consecuencias para la sociedad y el medio ambiente. Tiene la misión de advertir sobre los peligros volcánicos a las autoridades y a la población, para mitigar los riesgos asociados y así prevenir desastres. Varios de sus académicos son parte de Comités Científicos Asesores del Sistema Nacional de Protección Civil de la Secretaría de Seguridad y Protección Ciudadana del Gobierno de México y actúan en diversos organismos internacionales.