El microscopio de polarización es un Nikon OPTIPHOT2-POL (luz transmitida y reflejada). Se utiliza para el estudio petrográfico y visualizar las muestras en forma previa al análisis SEM o EPMA, en sección delgada o en muestra pulida. Para esto se cuenta con un microscopio petrográfico con capacidad para hacer observaciones con luz transmitida y reflejada. La resolución óptica del equipo es de 5X a 100X. Posee un adaptador con el fin de permitir la obtención de imágenes digitales de las muestras, que son enviadas directamente a una computadora para su procesamiento.

Para la obtención de imágenes, el microscopio cuenta con una cámara digital Hitachi KP-D51 COLOR DIGITAL, el cual, por medio de un adaptador, obteniene imágenes fijas de aspectos diversos de muestras. Estas imágenes se usan en la localización y elaboración de mapas de los minerales o puntos de interés analítico, o bien para procesamiento de las imágenes de minerales y rocas, con la paquetería disponible en el LUP. Adicionalmente, un escáner complementa estas funciones al permitir convertir a formato digital imágenes de materiales translúcidos (desde láminas delgadas de muestras por ejemplo), o bien a partir de fotografías impresas y así, construir mapas de localización de objetos de análisis o procesamiento de las imágenes con la paquetería de cómputo.