El laboratorio cuenta con un área específica con equipos, instrumentación, materiales y reactivos en donde se llevan a cabo la selección de las muestras, el procesamiento químico de las muestras para su posterior análisis micropaleontológico, o bien la preparación de muestras para su caracterización geoquímica y/o mineralógica.
Como parte de sus instalaciones se encuentra una sala de microscopía y documentación digital con equipos Carl Zeiss de última generación (3 microscopios Axioskop 40 con objetivos Planapo y 2 microscopios estereoscópicos Stemi 2000, dos).
Cuenta con un equipo de Fluorescencia de Rayos X Thermo Scientific Niton XL3t Serie 9000 GOLDD, que es un método no destructivo que permite la cuantificación química elemental.
Cuenta también con una cámara fría en donde se almacenan estos registros.